Kërkimi shkencor përfaqëson një nga aspektet kryesore të Universitetit Epoka. Universiteti Epoka është i përkushtuar të krijojë kushte të favorshme për aktivitete shkencore dhe kërkimore dhe të ndihmojë stafin akademik në arritjen e rezultateve konkurruese në nivel kombëtar dhe ndërkombëtar brenda burimeve dhe instrumenteve në dispozicion të institucionit.